最初随兄长麋竺仕于徐州牧陶谦,陶谦去世,刘备领徐州牧。麋芳与麋竺跟随刘备。刘备携民渡江,在长坂坡之战中,麋芳身带重伤,误认为赵云投降曹操,将其告诉刘备,但最后张飞证实赵云并没有投降。赤壁之战时,诸葛亮命糜芳与刘封、糜竺各驾船只擒拿败军。刘备入川后,庞统于落凤坡被张任射死,刘备大军困于涪水关,诸葛亮率领赵云、张飞领大军前往解围,出征前留马良、傅士仁、糜芳等辅佐关羽共守荆州。刘备平定益州后,封麋芳为南郡太守,与关羽共事。
襄樊之战前夕,糜芳、傅士仁大意烧毁了军器粮草,关羽怒欲问斩,费诗出面劝谏,二将得以保命,吕蒙白衣渡江攻打关羽时,傅士仁杀死关羽的催粮使者并诱使糜芳一起投降东吴,致使关羽失去援助而死亡。刘备伐吴时,二人杀马忠再次投蜀,但刘备认为二人因势急而投降,并非本意,愤怒的刘备命令关兴剥去二人衣服,命其亲自以刀剐杀,以祭奠关羽。